シナプスで起こるメチル化は、メチレーション回路によって作られるSAMeによって起こる。遺伝子変異や環境によって働きが左右される（この遺伝子変異を回避する一番のサプリメントが活性化葉酸）。シナプス間隙の神経伝達物質を減らす。