細胞内でのメラトニンの工場はミトコンドリア内。メラトニンを作るにはアセチルCoAが必要。メラトニンの合成過程は、トリプトファン→5ヒドロキシトリプトファン→Nアセチルセロトニン（NAS）→メラトニン。ピルビン酸から出来たアセチルCoAを利用してNASからメラトニンが作られる。