偏頭痛持ちの人は血清のイオン化マグネシウム値が低い。エストロゲン上昇により血中マグネシウムが各組織に移動し脳内のマグネシウムが少なくなり、カルシウム過剰になり、血管が収縮しすぎて偏頭痛に。気圧の低下により血管が拡張（膨張）し、戻すために血小板からセロトニンが放出される。血管収縮のためにセロトニンが放出され続けるとセロトニンが減少し、脳血管が急速に拡張することにより血管の周りの三叉神経に締め付けられ、偏頭痛が起こる。